14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3387 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3387  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  221  3e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0502  hypothetical protein  38.95 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.145396  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0462  hypothetical protein  38.95 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.129504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0467  hypothetical protein  41.46 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.62565  normal  0.624691 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00382  hypothetical protein  38.95 
 
 		 119 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00876967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00378  conserved hypothetical protein  38.95 
 
 		 125 aa  66.2  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00680553  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0059  hypothetical protein  36.49 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.182008  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12817  hypothetical protein  34.57 
 
 		 155 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3941  hypothetical protein  32 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4779  hypothetical protein  32 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1638  hypothetical protein, putative phage gene  32.93 
 
 		 95 aa  42  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0786  hypothetical protein  32.93 
 
 		 101 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3958  hypothetical protein  32.5 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4578  hypothetical protein  31.94 
 
 		 92 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.520748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>