15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2998 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2998  hypothetical protein  100 
 
 		 142 aa  291  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0148355  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2879  VirK  84.51 
 
 		 143 aa  253  9e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.149986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1391  VirK family protein  48.89 
 
 		 146 aa  122  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03361  VirK  44.12 
 
 		 143 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0194089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2875  VirK family protein  45.76 
 
 		 143 aa  112  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1194  VirK family protein  44.26 
 
 		 143 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2285  putative signal peptide protein  41.09 
 
 		 143 aa  99  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.685879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1256  hypothetical protein  40.2 
 
 		 104 aa  91.3  4e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1027  VirK protein  35.96 
 
 		 145 aa  75.9  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.242513  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0903  VirK family protein  35.96 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.927104  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0980  hypothetical protein  31.53 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.263356  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0891  hypothetical protein  31.53 
 
 		 144 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2196  hypothetical protein  28.1 
 
 		 156 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00124751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1796  hypothetical protein  25.83 
 
 		 138 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1795  hypothetical protein  27.89 
 
 		 138 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>