20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_1344 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1344  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  391  1e-108  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0765  hypothetical protein  79.07 
 
 		 189 aa  293  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.618728  normal  0.762349 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5028  hypothetical protein  51.05 
 
 		 203 aa  189  2e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0640594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0863  hypothetical protein  41.1 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.919764  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1060  hypothetical protein  37.66 
 
 		 154 aa  104  7e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.597208  normal  0.0759918 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03688  hypothetical protein  36.91 
 
 		 172 aa  102  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5416  cupin 2 domain-containing protein  36.84 
 
 		 149 aa  97.8  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.236661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3129  hypothetical protein  36.09 
 
 		 152 aa  97.1  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2381  hypothetical protein  31.97 
 
 		 180 aa  86.3  3e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1305  hypothetical protein  32.33 
 
 		 165 aa  85.5  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46817  predicted protein  29.71 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.410977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4231  cupin 2, barrel  30.53 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5207  hypothetical protein  30.77 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0098  hypothetical protein  27.42 
 
 		 267 aa  46.6  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1980  hypothetical protein  36.36 
 
 		 127 aa  46.2  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00382946 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4863  hypothetical protein  30.85 
 
 		 132 aa  43.9  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.368974  normal  0.880715 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4182  hypothetical protein  24.22 
 
 		 116 aa  43.9  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3522  hypothetical protein  36.36 
 
 		 152 aa  44.7  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0966069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1592  hypothetical protein  28.09 
 
 		 172 aa  42  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0782726  normal  0.106236 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1547  hypothetical protein  35.48 
 
 		 133 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683626  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>