14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0930 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0930  hypothetical protein  100 
 
 		 230 aa  474  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2092  hypothetical protein  36.16 
 
 		 231 aa  158  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8602  hypothetical protein  40.09 
 
 		 239 aa  153  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0242507  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1093  hypothetical protein  31.67 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3249  hypothetical protein  27.31 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000723413  normal  0.230465 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3199  hypothetical protein  28.38 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000115841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0955  hypothetical protein  26.07 
 
 		 239 aa  62  0.000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.494066 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2025  hypothetical protein  30.27 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117838  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12053  hypothetical protein  27.43 
 
 		 239 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1189  hypothetical protein  28.51 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9124  hypothetical protein  29.17 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.55888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0463  hypothetical protein  28.5 
 
 		 224 aa  58.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.841772  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5393  hypothetical protein  25 
 
 		 221 aa  46.6  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0264065 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12332  hypothetical protein  21.99 
 
 		 238 aa  41.6  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>