41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0709 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0709  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  498  1e-140  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0615  hypothetical protein  83.33 
 
 		 240 aa  419  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.651829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0349  nucleotidyl transferase  34.62 
 
 		 240 aa  158  9e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.309599  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1806  putative nucleotidyltransferase  31.22 
 
 		 241 aa  138  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.716393  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2595  UTP-glucose-1-phosphate uridylyltransferase  32.77 
 
 		 494 aa  129  5.0000000000000004e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.334164  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0305  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  28.51 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.297803  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0706  lipopolysaccharide biosynthesis protein, putative  30.88 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2464  nucleotidyl transferase  28.99 
 
 		 504 aa  112  7.000000000000001e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1803  dTDP-glucose pyrophosphorylase  28.81 
 
 		 241 aa  105  5e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0612  nucleotidyl transferase  27.65 
 
 		 253 aa  104  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.639702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0347  nucleotidyl transferase  29.75 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0798326  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0308  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative nucleotidyltransferase  28.64 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.684825  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2751  hypothetical protein  31.77 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0302  capsular polysaccharide biosynthesis protein  27.33 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.04779  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0423  hypothetical protein  21.52 
 
 		 254 aa  59.3  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1663  hypothetical protein  22.88 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2465  hypothetical protein  29.58 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1640  Nucleotidyl transferase  22.12 
 
 		 325 aa  53.9  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0220979  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0732  hypothetical protein  25.61 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14021  hypothetical protein  20.35 
 
 		 529 aa  52.8  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2596  dolichyl-phosphate mannose synthase  28.57 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.406323  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1304  Nucleotidyl transferase  22.75 
 
 		 330 aa  50.1  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3892  hypothetical protein  27.97 
 
 		 242 aa  49.7  0.00004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4096  hypothetical protein  27.97 
 
 		 242 aa  49.3  0.00005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541182 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1996  hypothetical protein  21.3 
 
 		 548 aa  47  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0665457 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0809  Nucleotidyl transferase  20.39 
 
 		 326 aa  45.8  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2610  hypothetical protein  23.29 
 
 		 247 aa  44.7  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2775  Nucleotidyl transferase  22.75 
 
 		 324 aa  44.3  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2750  hypothetical protein  19.55 
 
 		 258 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0089  Nucleotidyl transferase  21.88 
 
 		 257 aa  43.5  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.516862  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0407  Nucleotidyl transferase  27.84 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.120298  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2093  Nucleotidyl transferase  23.22 
 
 		 325 aa  43.1  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.165042  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3693  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  24.46 
 
 		 289 aa  42.7  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.701903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1140  Nucleotidyl transferase  22.32 
 
 		 247 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.497469  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0378  Nucleotidyl transferase  25.1 
 
 		 245 aa  42.7  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0925402 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0673  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  21.76 
 
 		 325 aa  42.7  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.004796  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3303  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase / diamine N-acetyltransferase  23.9 
 
 		 459 aa  42.4  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4255  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  26.34 
 
 		 296 aa  42.4  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1451  UDP-N-acetylglucosamine pyrophosphorylase  21.91 
 
 		 247 aa  42.4  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.76238  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06671  bifunctional N-acetylglucosamine-1-phosphate uridyltransferase/glucosamine-1-phosphate acetyltransferase  25.67 
 
 		 449 aa  42  0.008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.432114  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2354  glucose-1-phosphate thymidylyltransferase  25.81 
 
 		 296 aa  42  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>