14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5555 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5555  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  521  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.698137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63940  hypothetical protein  97.34 
 
 		 263 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2632  hypothetical protein  33.08 
 
 		 265 aa  131  1.0000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000104033  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2717  hypothetical protein  33.08 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.988672  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1576  hypothetical protein  32.69 
 
 		 265 aa  129  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3919  hypothetical protein  30.9 
 
 		 263 aa  106  5e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2496  hypothetical protein  26.67 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000716186  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2545  hypothetical protein  26.67 
 
 		 272 aa  86.3  5e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00421343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2374  hypothetical protein  22.58 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0894499  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0563  hypothetical protein  26.72 
 
 		 290 aa  54.3  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1192  hypothetical protein  24.53 
 
 		 177 aa  47  0.0003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.435819  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2857  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 279 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295819 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0562  putative methyltransferase  24.1 
 
 		 272 aa  43.1  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.272656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0040  alcohol dehydrogenase GroES-like protein  30 
 
 		 346 aa  42  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.992723  normal  0.309585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>