25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_5013 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_5013  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.812952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57690  hypothetical protein  100 
 
 		 148 aa  301  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0892  hypothetical protein  74.48 
 
 		 143 aa  221  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4701  hypothetical protein  73.1 
 
 		 144 aa  218  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.473328  normal  0.0524823 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4125  hypothetical protein  70.55 
 
 		 147 aa  216  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4431  hypothetical protein  72.11 
 
 		 147 aa  215  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0156474  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0916  hypothetical protein  71.23 
 
 		 145 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.302575  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1309  hypothetical protein  71.23 
 
 		 145 aa  212  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4415  hypothetical protein  71.23 
 
 		 145 aa  211  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.436054 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4540  hypothetical protein  70.55 
 
 		 145 aa  210  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12990  hypothetical protein  65.07 
 
 		 147 aa  199  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2698  hypothetical protein  34.03 
 
 		 145 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0925826  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3166  hypothetical protein  32.12 
 
 		 152 aa  72  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0881  hypothetical protein  27.71 
 
 		 207 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2209  hypothetical protein  27.89 
 
 		 173 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.12166  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1480  hypothetical protein  33.33 
 
 		 204 aa  51.6  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0576  protein of unknown function DUF1043  31.11 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0469  protein of unknown function DUF1043  33.7 
 
 		 187 aa  48.5  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0815  hypothetical protein  25.9 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000735018  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0101  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  26.83 
 
 		 145 aa  43.9  0.0008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000504995  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004513  hypothetical protein  26.4 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000444328  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00879  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  25.61 
 
 		 147 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3641  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  28.57 
 
 		 134 aa  42  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.230291  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4351  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  26.19 
 
 		 133 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00465453  hitchhiker  0.0029379 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3668  cytochrome d ubiquinol oxidase subunit III  26.44 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000236869  normal  0.162694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>