22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_1422 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_16360  hypothetical protein  96.29 
 
 		 620 aa  1181    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1077  hypothetical protein  52.85 
 
 		 631 aa  674    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.866744  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3728  hypothetical protein  75.44 
 
 		 621 aa  972    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3641  twin-arginine translocation pathway signal  57.92 
 
 		 636 aa  755    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1422  hypothetical protein  100 
 
 		 620 aa  1266    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1633  hypothetical protein  45.11 
 
 		 634 aa  512  1e-144  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00578112  normal  0.776269 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3083  FAD dependent oxidoreductase  42.83 
 
 		 650 aa  453  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.620429  normal  0.485634 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1454  twin-arginine translocation pathway signal  43.77 
 
 		 612 aa  434  1e-120  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1600  twin-arginine translocation pathway signal  45.06 
 
 		 610 aa  432  1e-119  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.624014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0365  hypothetical protein  39.06 
 
 		 644 aa  401  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0591662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0574  FAD dependent oxidoreductase  27.86 
 
 		 630 aa  185  3e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.186923  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1075  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 649 aa  167  5e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0882552 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4617  hypothetical protein  25.9 
 
 		 650 aa  159  1e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.119323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1123  FAD dependent oxidoreductase  48.84 
 
 		 494 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.176279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1295  hydroxyglutarate oxidase  48.78 
 
 		 409 aa  45.4  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1565  FAD dependent oxidoreductase  43.9 
 
 		 510 aa  45.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.377781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1485  amine oxidase  30.39 
 
 		 421 aa  45.1  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.584042  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5683  hypothetical protein  41.86 
 
 		 491 aa  45.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00144248 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1890  amine oxidase  35.38 
 
 		 433 aa  44.7  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3571  amine oxidase  30.71 
 
 		 461 aa  44.3  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.689303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2502  amine oxidase  28.57 
 
 		 557 aa  43.9  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0433  FAD dependent oxidoreductase  40.48 
 
 		 516 aa  43.9  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.266425  hitchhiker  0.0000000915051 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>