24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3862 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3862  phage assembly protein, putative  100 
 
 		 166 aa  329  9e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4589  Phage baseplate assembly protein V  68.52 
 
 		 170 aa  228  4e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1160  Phage baseplate assembly protein V  65.43 
 
 		 169 aa  220  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0187  phage baseplate assembly protein V  36.51 
 
 		 216 aa  110  7.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4479  bacteriophage Mu Gp45 protein  39.64 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0023741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2250  bacteriophage Mu Gp45 protein  39.64 
 
 		 177 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.217214 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2253  bacteriophage Mu Gp45 protein  44.53 
 
 		 177 aa  106  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000590369 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2586  phage baseplate assembly protein V  43.28 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0640174 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3735  Phage-related baseplate assembly protein V  35.33 
 
 		 193 aa  95.9  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1046  phage baseplate assembly protein V  36.59 
 
 		 197 aa  92.4  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0746  phage baseplate assembly protein V  28.05 
 
 		 208 aa  72.8  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3049  putative baseplate assembly protein Gp45,Mu-like  33.08 
 
 		 175 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000179717 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1872  phage baseplate assembly protein V  30.77 
 
 		 199 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000459886 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1814  putative phage baseplate assembly protein  35.85 
 
 		 172 aa  64.3  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2700  prophage MuSo2, baseplate assembly protein V  36.54 
 
 		 215 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2813  phage baseplate assembly protein V  26.75 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2735  phage baseplate assembly protein  26.75 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1471  phage baseplate assembly protein  26.75 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.388674 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3115  Mu Gp45 domain-containing protein  30.08 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4484  Mu-like prophage protein gp45-like protein  27.34 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1217  phage baseplate assembly protein V  38.67 
 
 		 159 aa  47.4  0.00009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2086  bacteriophage Mu Gp45 protein  27.86 
 
 		 193 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0743  bacteriophage Mu Gp45 protein  30.77 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0694  bacteriophage Mu Gp45 protein  30.77 
 
 		 204 aa  43.5  0.001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>