42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_3509 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_3509  glyoxalase family protein  100 
 
 		 125 aa  258  2e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.680863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2420  hypothetical protein  95.2 
 
 		 125 aa  249  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.464409  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2413  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  85.37 
 
 		 125 aa  223  6e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1778  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  69.42 
 
 		 121 aa  183  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0495016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3096  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  65 
 
 		 120 aa  171  1.9999999999999998e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0517504 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6147  hypothetical protein  61.95 
 
 		 177 aa  156  1e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.921426  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1523  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  58.47 
 
 		 130 aa  152  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.216178  normal  0.435654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1171  hypothetical protein  58.47 
 
 		 126 aa  151  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1751  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  57.38 
 
 		 122 aa  152  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1362  hypothetical protein  61.06 
 
 		 131 aa  150  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.678508  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0131  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  55.17 
 
 		 178 aa  146  8e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.613238 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  54.31 
 
 		 178 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3863  hypothetical protein  57.52 
 
 		 128 aa  144  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.525519  normal  0.340557 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2553  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  53.85 
 
 		 124 aa  142  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0666595  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0724  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  50.41 
 
 		 122 aa  133  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3161  hypothetical protein  46.43 
 
 		 117 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109728  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3453  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.43 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.727111  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3509  hypothetical protein  47.32 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3254  hypothetical protein  47.32 
 
 		 117 aa  121  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00230166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1795  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  46.43 
 
 		 119 aa  121  4e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3164  hypothetical protein  46.43 
 
 		 117 aa  120  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.70926  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3227  hypothetical protein  48.21 
 
 		 117 aa  120  6e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000491424  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1344  hypothetical protein  48.28 
 
 		 121 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1370  hypothetical protein  47.41 
 
 		 121 aa  117  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1508  hypothetical protein  47.37 
 
 		 121 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2245  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  48.67 
 
 		 193 aa  115  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3643  hypothetical protein  48.67 
 
 		 176 aa  111  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.609223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0126  hypothetical protein  45.69 
 
 		 175 aa  108  3e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5442  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  44.54 
 
 		 174 aa  105  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.128599  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1019  glyoxalase family protein  40 
 
 		 120 aa  99  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.757057  normal  0.50546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5790  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  47.79 
 
 		 120 aa  97.8  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1180  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.07 
 
 		 119 aa  84.7  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.94151 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2014  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.18 
 
 		 135 aa  81.6  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0040  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.94 
 
 		 126 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3048  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  37.27 
 
 		 109 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0259  glyoxalase family protein  49.15 
 
 		 59 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1026  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.86 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.742854  normal  0.054762 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0882  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.86 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0333259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2150  putative bleomycin resistance protein  30.95 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.717419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2267  hypothetical protein  80.77 
 
 		 50 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.771894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01370  hypothetical protein  29.52 
 
 		 129 aa  41.6  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3654  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.33 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.178047  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>