24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0950 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0950  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  236  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.888152  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10191  Fe-S-cluster oxidoreductase  84.35 
 
 
115 aa  206  9e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10181  Fe-S-cluster oxidoreductase  83.48 
 
 
115 aa  204  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09261  Fe-S-cluster oxidoreductase  67.83 
 
 
115 aa  171  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14501  Fe-S-cluster oxidoreductase  41.44 
 
 
124 aa  106  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2373  hypothetical protein  42.61 
 
 
116 aa  102  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.960402  normal  0.0667876 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2303  hypothetical protein  41.03 
 
 
122 aa  100  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.798576  normal  0.47016 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1158  hypothetical protein  41.82 
 
 
124 aa  100  8e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.308257  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3172  hypothetical protein  40.87 
 
 
116 aa  99.4  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2522  protein of unknown function UPF0153  39.32 
 
 
117 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.245259  normal  0.23939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3592  protein of unknown function UPF0153  39.32 
 
 
117 aa  99.4  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1317  hypothetical protein  39.09 
 
 
124 aa  96.7  8e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.161899 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2539  protein of unknown function UPF0153  36.52 
 
 
116 aa  97.1  8e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0589  Fe-S-cluster oxidoreductase-like  36.75 
 
 
220 aa  94.4  5e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0309459  normal  0.576133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4540  protein of unknown function UPF0153  33.91 
 
 
116 aa  88.6  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09121  Fe-S-cluster oxidoreductase  37.61 
 
 
121 aa  84.3  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.598462  hitchhiker  0.00000874271 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1958  hypothetical protein  39.44 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.781957  normal  0.865529 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4057  hypothetical protein  58.06 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2552  hypothetical protein  33.78 
 
 
96 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.230883  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0856  hypothetical protein  36.23 
 
 
97 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2318  hypothetical protein  31.88 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0137  hypothetical protein  35.62 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2546  hypothetical protein  53.33 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.211724  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003649  hypothetical protein  47.22 
 
 
69 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.13895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>