22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0801 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0801  hypothetical protein  100 
 
 
389 aa  772    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08541  hypothetical protein  85.01 
 
 
388 aa  669    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08571  hypothetical protein  85.27 
 
 
388 aa  671    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07881  hypothetical protein  66.76 
 
 
388 aa  504  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.85732  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09681  hypothetical protein  42.78 
 
 
384 aa  268  8.999999999999999e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.200555  hitchhiker  0.00527786 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1872  hypothetical protein  35.48 
 
 
386 aa  268  1e-70  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17421  hypothetical protein  37.47 
 
 
388 aa  264  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0201  hypothetical protein  42.42 
 
 
382 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.142897  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0781  hypothetical protein  35.58 
 
 
381 aa  232  7.000000000000001e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.354225  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08331  hypothetical protein  42.81 
 
 
325 aa  230  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.267137 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4381  hypothetical protein  32.65 
 
 
391 aa  227  3e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2511  protein of unknown function DUF129  35.99 
 
 
397 aa  215  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2400  hypothetical protein  30.51 
 
 
385 aa  209  5e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000734126  hitchhiker  0.00220183 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0992  hypothetical protein  33.17 
 
 
216 aa  136  6.0000000000000005e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000209758  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0887  hypothetical protein  32.35 
 
 
215 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000149264  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0905  protein of unknown function DUF129  33.33 
 
 
209 aa  129  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0487  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  31.16 
 
 
236 aa  102  8e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000293437  normal  0.460106 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5966  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.07 
 
 
893 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111384  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1618  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  24.05 
 
 
920 aa  71.6  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.308528  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10450  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  27.17 
 
 
938 aa  55.5  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00957139  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1632  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  22.78 
 
 
926 aa  50.8  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.740273 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19000  hypothetical protein  24.86 
 
 
509 aa  44.7  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.404915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>