28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0478 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0478  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 239 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05031  short chain dehydrogenase  88.7 
 
 		 239 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05331  short chain dehydrogenase  89.12 
 
 		 239 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.647746  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05411  short chain dehydrogenase  77.92 
 
 		 238 aa  338  4e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0882215  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06851  short chain dehydrogenase  48.02 
 
 		 256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1713  short chain dehydrogenase  45.85 
 
 		 249 aa  232  3e-60  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04781  short chain dehydrogenase  51.72 
 
 		 257 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.864402 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0646  short chain dehydrogenase  44.73 
 
 		 245 aa  218  5e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1810  short chain dehydrogenase  49.13 
 
 		 254 aa  205  5e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0109813  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05341  short chain dehydrogenase  46.96 
 
 		 254 aa  201  7e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.118311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0613  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  44.07 
 
 		 407 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0598  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  44.07 
 
 		 407 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3384  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  45.69 
 
 		 404 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0842787 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0861  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  41.28 
 
 		 429 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589823  normal  0.0593314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3742  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  44.98 
 
 		 420 aa  181  8.000000000000001e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843241  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1743  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  41.28 
 
 		 409 aa  178  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.505987  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4290  fatty acid hydroxylase  42.79 
 
 		 412 aa  171  6.999999999999999e-42  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_12277  hypothetical protein  24.68 
 
 		 423 aa  56.2  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50236  predicted protein  30.17 
 
 		 267 aa  48.5  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.370457  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0334  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.64 
 
 		 257 aa  46.2  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.422547  normal  0.568742 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0400  putative short-chain dehydrogenase, oxidoreductase  23.57 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0465203  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1096  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.1 
 
 		 256 aa  43.9  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0609  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.81 
 
 		 232 aa  43.5  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000037264  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.89 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  22.45 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2058  short chain dehydrogenase / reductase  33.33 
 
 		 221 aa  42.4  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.252145 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1637  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.76 
 
 		 171 aa  42  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.90867 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0895  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  23.04 
 
 		 245 aa  41.6  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0373369 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>