15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_57570 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009043  PICST_57570  predicted protein  100 
 
 
611 aa  1243    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0322438  normal  0.127832 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05630  SET domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G11040)  24 
 
 
707 aa  83.2  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.246527 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_42613  predicted protein  27.06 
 
 
453 aa  76.3  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48815  predicted protein  26.94 
 
 
519 aa  73.2  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04000  cytoplasm protein, putative  25.19 
 
 
455 aa  68.9  0.0000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46871  ribulose-1,5-bisphosphate carboxylase/oxygenase small subunit N-methyltransferase I  24.79 
 
 
575 aa  62.8  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.139312  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_14780  predicted protein  22.49 
 
 
514 aa  51.6  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.116373 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07340  conserved hypothetical protein  26.23 
 
 
441 aa  50.8  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.656294  normal 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34974  predicted protein  23.1 
 
 
327 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_49481  predicted protein  24.33 
 
 
1068 aa  48.1  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_25556  predicted protein  26.47 
 
 
431 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00000466514  normal  0.233957 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37749  predicted protein  30.34 
 
 
579 aa  46.6  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38974  predicted protein  34.25 
 
 
488 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.103286  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18374  predicted protein  37.18 
 
 
375 aa  44.3  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.892854  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34722  predicted protein  31.33 
 
 
524 aa  43.9  0.009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0720158  normal  0.0311419 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>