16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_55133 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009042  PICST_55133  predicted protein  100 
 
 
250 aa  515  1.0000000000000001e-145  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0189665  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02759  RNA processing protein Emg1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06010)  66.93 
 
 
260 aa  350  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.458215  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ01990  nucleolar essential protein 1, putative  67.3 
 
 
334 aa  340  9e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39810  predicted protein  44.8 
 
 
222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.368845  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_11653  predicted protein  44.77 
 
 
174 aa  151  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0432988  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0045  Suppressor Mra1 family protein  30.32 
 
 
223 aa  73.9  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0188  ribosome biogenesis protein  28.57 
 
 
226 aa  72.4  0.000000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0485311  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0557  ribosome biogenesis protein  35.25 
 
 
232 aa  71.6  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0915  Suppressor Mra1 family protein  29.69 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13379  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0625  ribosome biogenesis protein  32.59 
 
 
228 aa  65.1  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0820  ribosome biogenesis protein  30.82 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1590  ribosome biogenesis protein  35.44 
 
 
221 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1803  ribosome biogenesis protein  28.99 
 
 
221 aa  52.4  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.022092  normal  0.296556 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2054  ribosome biogenesis protein  28.14 
 
 
221 aa  52.8  0.000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.532085 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1625  ribosome biogenesis protein  26.11 
 
 
222 aa  52.4  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0747  ribosome biogenesis protein  36.25 
 
 
209 aa  50.4  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0675798  normal  0.0968898 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>