26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_54178 on replicon NC_009042
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009042  PICST_54178  C2H2 zinc finger protein  100 
 
 		 1158 aa  2407    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_67179  C2H2 zinc finger protein Ribonuc_L-PSP Endoribonuclease L-PSP  30.67 
 
 		 724 aa  254  6e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42941  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  30.37 
 
 		 794 aa  240  9e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.48255  normal  0.719128 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06733  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05960)  25.43 
 
 		 1003 aa  190  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.425426  normal  0.941684 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29464  C2H2 zinc finger protein  25.38 
 
 		 712 aa  76.3  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_11197  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  21.75 
 
 		 865 aa  72.8  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05659  C2H2 finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13600)  38.36 
 
 		 314 aa  56.6  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.504143  normal  0.402807 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51364  protein similar to protein that controls the expression of ADH2, peroxisomal protein genes, and genes required for ethanol, glycerol, and fatty acid utilization  30 
 
 		 1211 aa  51.2  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0352495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61434  calcineurin responsive zinc-finger  43.1 
 
 		 225 aa  50.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.383997 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08357  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G00750)  28.74 
 
 		 632 aa  48.9  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02270  Putative uncharacterized proteinRegulatory protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q00170]  34.43 
 
 		 880 aa  47.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.132448  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00870  RNA polymerase II transcription factor, putative  41.94 
 
 		 650 aa  47.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33273  zf-C2H2 Zinc finger, C2H2 type  30.39 
 
 		 857 aa  47  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0974911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_67778  ADR1-like Zn finger domain protein  30.26 
 
 		 1049 aa  46.6  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.119069 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03060  C2H2 zinc finger protein Zas1A, putative  25.35 
 
 		 1078 aa  47.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04873  C2H2 transcription factor (Swi5), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G11250)  32.86 
 
 		 741 aa  47  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.342827 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00390  expressed protein  30.28 
 
 		 691 aa  46.2  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05966  RfeC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q8J177]  35 
 
 		 519 aa  46.2  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.247112  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07118  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  34.92 
 
 		 991 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11112  Putative transcription factor with C2H2 and Zn(2)-Cys(6) DNA binding domain (Eurofung)  23.67 
 
 		 446 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04720  Putative C2H2 finger domain transcription factor (Eurofung)  32.53 
 
 		 313 aa  45.8  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000217487  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03730  conserved hypothetical protein  20.57 
 
 		 819 aa  45.8  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50873  ADR1-like protein  34.67 
 
 		 146 aa  45.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80960  Zinc Finger Protein C2H2-like protein  32.2 
 
 		 1195 aa  45.1  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.758804  normal  0.0450473 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04013  C2H2 transcription factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04110)  33.33 
 
 		 864 aa  45.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64902  possible regulatory protein  35.59 
 
 		 675 aa  45.1  0.008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.459104  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>