23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_47064 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_47064  predicted protein  100 
 
 
198 aa  402  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.131111 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_72814  predicted protein  39.56 
 
 
244 aa  150  1e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.146555 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06860  hypothetical protein  39.13 
 
 
189 aa  115  3e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01247  integral membrane protein, Mpv17/PMP22 family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G10340)  30.48 
 
 
252 aa  91.7  7e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03412  integral membrane protein, Mpv17/PMP22 family, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01470)  30.99 
 
 
202 aa  87.4  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.926625 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15341  predicted protein  35 
 
 
174 aa  86.7  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0601041  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL05590  hypothetical protein  29.86 
 
 
217 aa  83.2  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22819  predicted protein  28.72 
 
 
185 aa  74.3  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134884  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30479  predicted protein  28.65 
 
 
240 aa  64.3  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12379  predicted protein  25 
 
 
179 aa  63.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_12262  predicted protein  28.11 
 
 
177 aa  62.8  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31436  predicted protein  25.39 
 
 
238 aa  59.3  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0440287  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16632  predicted protein  25.84 
 
 
186 aa  57.8  0.00000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0983829  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8963  predicted protein  23.76 
 
 
226 aa  57.4  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.66909  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47402  predicted protein  30.24 
 
 
330 aa  55.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.335962  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16592  predicted protein  26.34 
 
 
187 aa  55.5  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00540575  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00731  integral membrane protein, Mpv17/PMP22 family, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G13840)  24.15 
 
 
305 aa  51.6  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27860  predicted protein  24.74 
 
 
409 aa  49.3  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.572712  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_52252  predicted protein  28.28 
 
 
307 aa  47  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.463289  normal  0.10545 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07258  hypothetical protein similar to 25D9-6 (Broad)  24.24 
 
 
252 aa  47  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145311  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_7358  predicted protein  23.78 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.61572  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06626  integral membrane protein, Mpv17/PMP22 family, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G03910)  25.26 
 
 
212 aa  43.5  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.455126  normal  0.687506 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_8121  predicted protein  21.74 
 
 
129 aa  43.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.300173  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>