17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32542 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_32542  multicatalytic endopeptidase  100 
 
 		 312 aa  649    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0971418 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04492  proteasome regulatory particle subunit (RpnK), putative (AFU_orthologue; AFUA_2G03400)  66.67 
 
 		 338 aa  442  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0684928  normal  0.0283243 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02100  multidrug resistance protein, putative  66.23 
 
 		 310 aa  418  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35481  predicted protein  62.99 
 
 		 307 aa  416  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0686481  normal  0.028016 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_20227  regulatory proteasome non-atpase subunit 11  58.33 
 
 		 311 aa  377  1e-104  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02129  COP9 signalosome complex subunit 5 (EC 3.4.-.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBF1]  33.45 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_4539  predicted protein  40.1 
 
 		 328 aa  133  5e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.251413 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02350  conserved hypothetical protein  38.73 
 
 		 371 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_12458  COP9 signalosome subunit 5A / CSN subunit 5A (CSN5A) / c-JUN coactivator protein AJH2, putative (AJH2)  36.6 
 
 		 218 aa  115  7.999999999999999e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0331122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_43086  COP9 SigNalosome subunit 5  28.45 
 
 		 370 aa  68.2  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05121  hypothetical protein similar to proteasome regulatory subunit 8 RPN8 (Eurofung)  29.29 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01270  Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit H (eIF3h) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDW0]  28.86 
 
 		 366 aa  53.5  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.82335  normal  0.783185 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41604  predicted protein  25.31 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_19171  predicted protein  25.31 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46961  predicted protein  26.06 
 
 		 338 aa  48.5  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1093  Mov34/MPN/PAD-1 family protein  28.38 
 
 		 156 aa  45.8  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00128248  normal  0.047674 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03003  endosome-associated ubiquitin isopeptidase (AmsH), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G08730)  25.44 
 
 		 544 aa  45.8  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.384075  normal  0.162013 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>