10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_8543 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_8543  predicted protein  100 
 
 
69 aa  117  3.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44994  predicted protein  50 
 
 
840 aa  49.7  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0685164  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51761  predicted protein  45.59 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.935673  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48493  predicted protein  58.73 
 
 
551 aa  48.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0000192267  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49133  predicted protein  39.13 
 
 
590 aa  45.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_8596  predicted protein  47.76 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_8538  predicted protein  47.76 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_8537  predicted protein  50 
 
 
65 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400329  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44995  predicted protein  50 
 
 
1217 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00833272  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_49571  predicted protein  36.23 
 
 
1000 aa  41.2  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.822968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>