30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATR_33214 on replicon NC_011671
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011671  PHATR_33214  predicted protein  100 
 
 
189 aa  394  1e-109  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1801  hypothetical protein  33.67 
 
 
128 aa  60.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2190  protein of unknown function DUF498  37.23 
 
 
129 aa  58.2  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2857  protein of unknown function DUF498  32.67 
 
 
132 aa  55.5  0.0000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0635167 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1175  hypothetical protein  32.63 
 
 
128 aa  55.1  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0610341 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1003  hypothetical protein  35.51 
 
 
124 aa  54.7  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349077  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4745  protein of unknown function DUF498  35 
 
 
132 aa  54.7  0.0000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0214225 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1762  hypothetical protein  34.62 
 
 
124 aa  54.3  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2493  hypothetical protein  35.79 
 
 
129 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.688311 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3170  protein of unknown function DUF498  31.91 
 
 
127 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0438826  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4226  hypothetical protein  34 
 
 
131 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.75758  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4596  protein of unknown function DUF498  34 
 
 
131 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  0.133162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2775  hypothetical protein  29.29 
 
 
127 aa  51.2  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648943  normal  0.66012 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1767  hypothetical protein  30.61 
 
 
128 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.119817  hitchhiker  0.00949574 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2657  hypothetical protein  27.66 
 
 
128 aa  48.1  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1795  hypothetical protein  32.63 
 
 
129 aa  48.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.281599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4404  hypothetical protein  27.66 
 
 
127 aa  47.8  0.00009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150863  normal  0.160891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2278  hypothetical protein  29.23 
 
 
132 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2730  hypothetical protein  29.41 
 
 
127 aa  46.6  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.117321  normal  0.234166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2774  hypothetical protein  27.66 
 
 
128 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.274948 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1695  protein of unknown function DUF498  29.47 
 
 
128 aa  45.1  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1497  protein of unknown function DUF498  30.53 
 
 
128 aa  44.7  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.54938 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1283  protein of unknown function DUF498  36.78 
 
 
126 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.667566  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4311  hypothetical protein  32.26 
 
 
120 aa  44.3  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0888  hypothetical protein  28.42 
 
 
129 aa  43.9  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0892  hypothetical protein  28.42 
 
 
129 aa  43.1  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2335  hypothetical protein  28.42 
 
 
129 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.247387  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1824  hypothetical protein  31.96 
 
 
124 aa  41.2  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3038  hypothetical protein  27.27 
 
 
122 aa  41.2  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1553  hypothetical protein  29.27 
 
 
126 aa  41.2  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>