19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_54688 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_16379  predicted protein  47.8 
 
 
769 aa  670    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.191953  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54688  predicted protein  100 
 
 
1027 aa  2136    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_52058  predicted protein  48.26 
 
 
867 aa  685    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40911  predicted protein  38.08 
 
 
1453 aa  525  1e-147  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.844333  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_432  predicted protein  38.1 
 
 
867 aa  521  1e-146  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_75361  Myosin-2 (Class V unconventional myosin MYO2) (Type V myosin heavy chain MYO2) (Myosin V MYO2)  36.37 
 
 
1571 aa  516  1e-144  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.120834 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08862  Aspergillus nidulans myosin V homolog (Eurofung)  37.01 
 
 
1569 aa  496  1e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_66079  Myosin-1 (Type II myosin)  35.73 
 
 
1874 aa  451  1e-125  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.549994 
 
 
-
 
NC_006686  CND05780  MYO2-related  34.36 
 
 
1576 aa  437  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.134577  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04706  myosin II homolog (Eurofung)  37.01 
 
 
2404 aa  436  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC06470  nonmuscle myosin heavy chain b, putative  35.5 
 
 
1625 aa  421  1e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.347127  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_292  predicted protein  37.65 
 
 
763 aa  421  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01558  Myosin-1 (Class I unconventional myosin)(Type I myosin) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q00647]  35.24 
 
 
1249 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.294157  normal  0.0868257 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51848  predicted protein  32.33 
 
 
932 aa  375  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79258  Myosin-5 isoform  32.53 
 
 
1256 aa  363  1e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04540  microfilament motor, putative  34.04 
 
 
1274 aa  360  7e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25867  predicted protein  30.58 
 
 
804 aa  325  2e-87  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01610  chitin synthase-related  25.91 
 
 
1895 aa  194  7e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06318  Chitin synthasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O13281]  23.07 
 
 
1852 aa  120  9.999999999999999e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15619  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>