26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_35196 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_35196  predicted protein  100 
 
 		 328 aa  690    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04170  conserved hypothetical protein  28.17 
 
 		 696 aa  88.2  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.557768  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10251  RING and UBP finger domain protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G10360)  25.4 
 
 		 503 aa  82.4  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34718  predicted protein  28.05 
 
 		 475 aa  80.5  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.151191  normal  0.0293051 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58891  predicted protein  27.5 
 
 		 596 aa  78.2  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0650086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_65573  predicted protein  42.59 
 
 		 803 aa  55.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.227667 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1037  zinc finger, UBP-type  37.5 
 
 		 108 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02660  ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 14, putative  41.51 
 
 		 796 aa  49.7  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.989129  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5493  zinc finger UBP-type protein  45.16 
 
 		 90 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.206165  normal  0.462948 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1047  zinc finger, UBP-type  44.12 
 
 		 101 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563761  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0986  zinc finger, UBP-type  44.12 
 
 		 101 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1043  zinc finger, UBP-type  44.12 
 
 		 101 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.394296  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2250  hypothetical protein  33.7 
 
 		 115 aa  47.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.296979  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6890  hypothetical protein  45.16 
 
 		 90 aa  47.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7025  zinc finger UBP-type protein  37.5 
 
 		 90 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.966093  normal  0.19341 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4964  hypothetical protein  38.57 
 
 		 113 aa  46.6  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.126109 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2514  hypothetical protein  41.18 
 
 		 86 aa  46.2  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.410014  normal  0.479427 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1954  hypothetical protein  38.96 
 
 		 99 aa  44.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4885  hypothetical protein  31.11 
 
 		 115 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.129018 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4589  hypothetical protein  31.11 
 
 		 115 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.455193 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4502  hypothetical protein  31.11 
 
 		 115 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3395  hypothetical protein  35.16 
 
 		 115 aa  43.1  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.825014  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0512  zinc finger, UBP-type protein  45.16 
 
 		 109 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0534  zinc finger, UBP-type protein  45.16 
 
 		 109 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.990662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0522  Zinc finger, UBP-type  45.16 
 
 		 109 aa  43.1  0.007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2623  zinc finger, UBP-type  50 
 
 		 87 aa  42.4  0.01  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000246192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>