12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32929 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_32929  predicted protein  100 
 
 
794 aa  1633    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.508293  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_46998  predicted protein  36.86 
 
 
480 aa  232  2e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.291299  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13553  predicted protein  43.68 
 
 
250 aa  209  2e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0118726  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_5491  predicted protein  37.17 
 
 
210 aa  174  5e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.223661  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36848  predicted protein  30.36 
 
 
424 aa  166  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36842  predicted protein  27.72 
 
 
762 aa  156  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34117  predicted protein  27.92 
 
 
516 aa  120  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  decreased coverage  0.00012281  normal  0.103056 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10377  DUF580 domain protein Pns1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12970)  24.3 
 
 
533 aa  118  3.9999999999999997e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.173426  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00640  integral to plasma membrane protein, putative  25.48 
 
 
551 aa  87  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00800  expressed protein  27.47 
 
 
699 aa  68.2  0.0000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33567  predicted protein  23.4 
 
 
396 aa  60.1  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.416798  normal  0.0211717 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45782  predicted protein  25.64 
 
 
658 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>