22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_32290 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_32290  predicted protein  100 
 
 		 684 aa  1434    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10962  interstrand crosslink repair protein (Eurofung)  35.44 
 
 		 832 aa  151  3e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG04070  conserved hypothetical protein  39.23 
 
 		 811 aa  139  2e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.96924  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_3060  predicted protein  36.36 
 
 		 346 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.206644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_44277  predicted protein  36.44 
 
 		 368 aa  131  3e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00870525 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_56782  predicted protein  31.29 
 
 		 628 aa  118  3.9999999999999997e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_47094  predicted protein  28.34 
 
 		 503 aa  109  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_17702  predicted protein  29.07 
 
 		 411 aa  86.7  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.257016 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_40815  predicted protein  31.79 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0533421  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01200  expressed protein  26.01 
 
 		 758 aa  72.8  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00437  DNA repair protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G04570)  29.73 
 
 		 845 aa  62.8  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.775561  normal  0.182643 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1313  beta-lactamase domain-containing protein  27.36 
 
 		 315 aa  54.7  0.000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.143027  normal  0.259963 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1893  beta-lactamase domain protein  26.28 
 
 		 411 aa  50.4  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.411885  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0446  beta-lactamase domain-containing protein  26.92 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.279355  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0973  putative mRNA 3-end processing factor  32.18 
 
 		 314 aa  48.5  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.289039 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4103  beta-lactamase-like  31.65 
 
 		 539 aa  48.1  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.352914 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1796  beta-lactamase domain protein  27.46 
 
 		 414 aa  47.8  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1883  putative mRNA 3-end processing factor  28.68 
 
 		 327 aa  47.4  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.115808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1043  putative mRNA 3-end processing factor  24.56 
 
 		 319 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0008566 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0378  beta-lactamase domain protein  24.82 
 
 		 411 aa  46.6  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.834555  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3813  beta-lactamase domain-containing protein  26.7 
 
 		 571 aa  45.8  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.656943  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1313  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  24.81 
 
 		 432 aa  43.9  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.920627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>