17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_23582 on replicon NC_011693
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011693  PHATRDRAFT_23582  predicted protein  100 
 
 
764 aa  1576    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF00890  importin beta-4 subunit, putative  29.29 
 
 
1080 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69154  ran binding protein  24.66 
 
 
1103 aa  194  6e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0595728  normal  0.755477 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02120  importin subunit beta-4, putative (JCVI)  23.79 
 
 
1093 aa  183  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36650  predicted protein  30.34 
 
 
979 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0159374  normal  0.125741 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41924  predicted protein  30.34 
 
 
979 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.123239  normal  0.112463 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_25726  predicted protein  22.99 
 
 
1015 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.779434  decreased coverage  0.000347416 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03370  protein carrier, putative  27.27 
 
 
907 aa  106  1e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0220486  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05717  importin beta-3 subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06790)  21.09 
 
 
1095 aa  105  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_69854  Karyopherin Functions in nuclear transport of proteins  22.16 
 
 
1090 aa  94.7  6e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80310  predicted protein  25.29 
 
 
938 aa  69.3  0.0000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00926  KapC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2LD07]  23.77 
 
 
939 aa  60.8  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.335104  normal  0.533348 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01010  importin beta-2 subunit, putative  24.56 
 
 
924 aa  57.8  0.0000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29487  predicted protein  25.93 
 
 
910 aa  55.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.505299  decreased coverage  0.00488082 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31809  predicted protein  23.59 
 
 
677 aa  48.5  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.128355 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02430  regulation of translational elongation-related protein, putative  22.74 
 
 
2611 aa  44.7  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10734  translational activator, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G07960)  20.06 
 
 
2672 aa  44.3  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.257702 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>