16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1977 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1977  hypothetical protein  100 
 
 		 668 aa  1366    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.839375 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2537  hypothetical protein  23.85 
 
 		 675 aa  150  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6882  hypothetical protein  26.86 
 
 		 669 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.448154 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3878  hypothetical protein  23.52 
 
 		 705 aa  134  6e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1497  hypothetical protein  22.57 
 
 		 685 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.559508 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5160  hypothetical protein  24 
 
 		 692 aa  98.2  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.307901 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0478  hypothetical protein  31.38 
 
 		 656 aa  95.1  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.522287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0543  hypothetical protein  29.17 
 
 		 686 aa  93.2  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.792006  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1996  hypothetical protein  27.21 
 
 		 673 aa  85.5  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0495  hypothetical protein  27.52 
 
 		 687 aa  76.6  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.591683  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1687  hypothetical protein  25.64 
 
 		 692 aa  74.7  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0498  hypothetical protein  23.5 
 
 		 678 aa  70.9  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1174  hypothetical protein  24.71 
 
 		 658 aa  69.7  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0442  hypothetical protein  28.98 
 
 		 667 aa  68.6  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.57789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2457  hypothetical protein  22.38 
 
 		 663 aa  62  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0959511 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2273  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  44.23 
 
 		 259 aa  44.7  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.231171 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>