15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1818 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1818  hypothetical protein  100 
 
 
238 aa  489  1e-137  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1102  hypothetical protein  36.59 
 
 
404 aa  128  6e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1573  hypothetical protein  33.79 
 
 
418 aa  102  4e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00652866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1845  hypothetical protein  31.67 
 
 
411 aa  97.4  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1807  hypothetical protein  29.18 
 
 
411 aa  94  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0398  hypothetical protein  29.28 
 
 
410 aa  90.9  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0194907  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0652  hypothetical protein  30.77 
 
 
411 aa  90.1  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.828544  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2775  hypothetical protein  26.76 
 
 
412 aa  90.1  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.717789  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2045  hypothetical protein  28.96 
 
 
408 aa  86.7  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.107819  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1682  hypothetical protein  27.96 
 
 
422 aa  80.1  0.00000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.246991  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2071  cytochrome c assembly protein  41.86 
 
 
883 aa  44.7  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.183227 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0862  LigA  34.48 
 
 
544 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0814  LigA  34.48 
 
 
557 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0866  LigA  34.48 
 
 
542 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2074  ResB protein required for cytochrome c biosynthesis-like protein  32.35 
 
 
336 aa  42  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>