23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1270 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1270  hypothetical protein  100 
 
 
309 aa  643    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0193  hypothetical protein  47.73 
 
 
309 aa  309  2.9999999999999997e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0365  pentein-type domain-containing protein  47.1 
 
 
311 aa  292  4e-78  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.529714  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5776  hypothetical protein  44.66 
 
 
318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1720  pentein-type domain-containing protein  45.51 
 
 
310 aa  268  7e-71  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0873915  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05890  hypothetical protein  44.98 
 
 
309 aa  268  8e-71  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4680  hypothetical protein  44.7 
 
 
308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3491  amidinotransferase  43.87 
 
 
333 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.736651  normal  0.0264598 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02830  uncharacterized conserved protein with pentein-type domain  44.01 
 
 
340 aa  250  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1164  amidinotransferase family protein  42.19 
 
 
309 aa  246  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.0253709 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5310  amidinotransferase  42.9 
 
 
346 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3944  amidinotransferase  42.58 
 
 
336 aa  246  3e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271139  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2023  amidinotransferase family protein  42.22 
 
 
362 aa  242  6e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.136244  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3576  amidinotransferase  41.94 
 
 
354 aa  242  7e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0346338  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2543  amidinotransferase  41.67 
 
 
333 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0243  hypothetical protein  41.23 
 
 
326 aa  222  6e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2881  hypothetical protein  40.53 
 
 
303 aa  219  7e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2742  hypothetical protein  39.87 
 
 
303 aa  217  2e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00362  hypothetical protein  41.53 
 
 
319 aa  216  5e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.117319  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2391  hypothetical protein  40.34 
 
 
305 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.482221  normal  0.798046 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001028  hypothetical protein  39.29 
 
 
333 aa  211  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07112  hypothetical protein  38.71 
 
 
336 aa  200  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31738  predicted protein  39.02 
 
 
302 aa  186  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.193058  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>