26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1042 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1042  glycogen synthase, putative  100 
 
 		 548 aa  1140    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0023004 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1285  alpha-glucan phosphorylase  39.49 
 
 		 1413 aa  385  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0468  alpha-glucan phosphorylase  32.79 
 
 		 1421 aa  292  1e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.06142  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1581  glycogen synthase, glycosyltransferase family 3 protein  28.74 
 
 		 604 aa  238  3e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0619337  normal  0.0568049 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08010  glycogen synthase (Eurofung)  29.72 
 
 		 711 aa  227  4e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.53633  normal  0.197205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5697  Glycogen(starch) synthase  28.29 
 
 		 606 aa  221  1.9999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3735  Glycogen (starch) synthase  28.81 
 
 		 604 aa  221  1.9999999999999999e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.860093 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00590  glycogen (starch) synthase, putative  28.09 
 
 		 733 aa  207  3e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81231  glycogen (starch) synthase  29.14 
 
 		 699 aa  135  9.999999999999999e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.490915  normal  0.0297098 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1552  glycogen synthase  24.62 
 
 		 594 aa  55.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.575386  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0296  hypothetical protein  23.98 
 
 		 603 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2598  glycosyl transferase group 1  35.37 
 
 		 418 aa  47.4  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1867  glycosyl transferase, group 1  36.25 
 
 		 412 aa  47  0.0009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1847  glycosyl transferase, group 1  36.25 
 
 		 412 aa  47  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.469612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1913  glycosyl transferase, group 1  36.25 
 
 		 412 aa  47  0.0009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.434704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4226  glycosyl transferase group 1  32.32 
 
 		 370 aa  46.2  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.333329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5022  glycosyl transferase group 1  29.36 
 
 		 395 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0433  hypothetical protein  23.08 
 
 		 601 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.430655  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0295  hypothetical protein  26.28 
 
 		 413 aa  45.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0201  hypothetical protein  29.75 
 
 		 935 aa  45.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0558  glycosyl transferase group 1  25.13 
 
 		 381 aa  44.3  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4015  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 		 384 aa  43.9  0.007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 424 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  30.43 
 
 		 426 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2522  putative glycosyltransferase, group 1  30.58 
 
 		 392 aa  43.5  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247085  normal  0.0251754 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0894  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 		 381 aa  43.5  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.346832  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>