17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3625 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3625  hypothetical protein  100 
 
 
133 aa  267  4e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0951  hypothetical protein  42.19 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.13257 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  38.1 
 
 
64 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3400  hypothetical protein  36.92 
 
 
65 aa  52.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00844504  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4044  hypothetical protein  31.58 
 
 
63 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345099  normal  0.110238 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3607  hypothetical protein  33.93 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5455  hypothetical protein  34.62 
 
 
99 aa  43.9  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00632122 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6385  hypothetical protein  34.62 
 
 
99 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  0.609556 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44400  hypothetical protein  35.42 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0752085  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3667  hypothetical protein  26.32 
 
 
63 aa  42  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4912  hypothetical protein  30.36 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6051  hypothetical protein  34.62 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0458725 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5637  hypothetical protein  32.69 
 
 
99 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.364961  normal  0.0737283 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1064  hypothetical protein  24.59 
 
 
63 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6459  hypothetical protein  32.69 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.624579  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1370  hypothetical protein  32.69 
 
 
99 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0344819  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3285  hypothetical protein  32.14 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>