9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2390 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2390  TonB family protein  100 
 
 		 474 aa  916    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.600506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3033  TonB family protein  30.36 
 
 		 528 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3088  TonB family protein  30.36 
 
 		 528 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0726849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2420  TonB family protein  28.8 
 
 		 443 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0829396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  41.41 
 
 		 925 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  28.46 
 
 		 1888 aa  47  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2295  TonB-like  32.26 
 
 		 507 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.459858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1940  Cold-shock protein DNA-binding protein  37.23 
 
 		 290 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.376241  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03476  TonB protein  36.36 
 
 		 184 aa  43.9  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>