12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2212 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2212  hypothetical protein  100 
 
 
263 aa  533  1e-150  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000676679 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2262  peptidase metallopeptidase  61.93 
 
 
268 aa  265  4e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2313  peptidase metallopeptidase  61.42 
 
 
268 aa  263  2e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.375017 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0725  peptidase, metallopeptidase  49.38 
 
 
254 aa  228  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.364392  normal  0.750618 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2544  peptidase metallopeptidase  51.18 
 
 
264 aa  215  7e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1836  peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin  49.76 
 
 
234 aa  191  1e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.764837  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4038  hypothetical protein  47.91 
 
 
257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00794485 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0467  peptidase, metallopeptidase  39.44 
 
 
277 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1002  hypothetical protein  30.73 
 
 
221 aa  82.4  0.000000000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.222918  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0907  peptidase, metallopeptidase  29.23 
 
 
213 aa  69.3  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.20081  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18281  hypothetical protein  40 
 
 
73 aa  48.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.136589 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0820  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  32.95 
 
 
244 aa  43.1  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.101755 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>