69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3286 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_3286  Ankyrin  100 
 
 
708 aa  1461    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3433  Ankyrin  80.99 
 
 
716 aa  1177    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.314955  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3434  Ankyrin  35.71 
 
 
679 aa  379  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.692193  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3287  Ankyrin  35.72 
 
 
678 aa  369  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.63346  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0761  ankyrin domain-containing protein  30.76 
 
 
818 aa  293  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0757  ankyrin  30.38 
 
 
816 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0915  ankyrin domain-containing protein  30.52 
 
 
816 aa  285  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08019  Pfs, NACHT and Ankyrin domain protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01020)  25.41 
 
 
1156 aa  66.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.596222  hitchhiker  0.00162932 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4314  ankyrin  27.3 
 
 
426 aa  63.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.327235  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  20.18 
 
 
1585 aa  62.4  0.00000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0229  Ankyrin  21.57 
 
 
715 aa  62.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.0000140183  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1347  Ankyrin  23.51 
 
 
404 aa  62.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  25.37 
 
 
870 aa  61.6  0.00000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1217  hypothetical protein  26.72 
 
 
1402 aa  60.1  0.0000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000624156 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14960  Ankyrin  25.4 
 
 
483 aa  60.1  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000388228  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0897  ankyrin  23.99 
 
 
393 aa  59.3  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0130242  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0703  hypothetical protein  24.53 
 
 
762 aa  58.2  0.0000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01130  conserved hypothetical protein  25.64 
 
 
1030 aa  55.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.329359  normal  0.12831 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  27.85 
 
 
931 aa  55.5  0.000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2380  hypothetical protein  25.3 
 
 
305 aa  52.8  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.691759  normal  0.155983 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0636  hypothetical protein  22.89 
 
 
545 aa  52.8  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0395  Ankyrin  25.09 
 
 
640 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0738  hypothetical protein  23.26 
 
 
1005 aa  53.1  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0550  ankyrin repeat-containing protein  32.17 
 
 
329 aa  52  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1096  ankyrin  23.95 
 
 
1061 aa  50.8  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0912242  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1380  ankyrin  24.79 
 
 
216 aa  50.8  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3570  ankyrin  24.91 
 
 
431 aa  50.8  0.00009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.85862  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0147  ankyrin repeat-containing protein  25.95 
 
 
954 aa  50.4  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4090  hypothetical protein  36.78 
 
 
427 aa  50.4  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  22.12 
 
 
2413 aa  49.7  0.0002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00782  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_1G14510)  34.62 
 
 
1139 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08767  ankyrin repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_3G02830)  26.32 
 
 
855 aa  49.7  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0941887  normal  0.535904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2151  Ankyrin  25 
 
 
490 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.712677 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  26.74 
 
 
865 aa  48.9  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2681  Ankyrin  21.78 
 
 
426 aa  48.5  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000315843  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29424  predicted protein  29.17 
 
 
565 aa  48.1  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0916704 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02348  conserved hypothetical protein  37.61 
 
 
952 aa  48.1  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0452747  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0766  ankyrin repeat-containing protein  24.82 
 
 
474 aa  48.1  0.0005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.705844  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2199  ankyrin repeat-containing protein  23.89 
 
 
442 aa  48.1  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1221  hypothetical protein  24.17 
 
 
472 aa  48.1  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000594421 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0849  hypothetical protein  23.63 
 
 
723 aa  48.1  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.048411 
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  25.84 
 
 
542 aa  48.1  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0382  ankyrin repeat protein  24.7 
 
 
891 aa  47.4  0.0008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0225  hypothetical protein  26.23 
 
 
423 aa  47.4  0.0009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.728925 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0228  hypothetical protein  29.23 
 
 
750 aa  47.4  0.0009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.871268 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0224  hypothetical protein  22.01 
 
 
404 aa  47.4  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.505071 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08304  conserved hypothetical protein  24.24 
 
 
1198 aa  47.4  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.0000526329 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1784  hypothetical protein  36.9 
 
 
511 aa  46.6  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1153  hypothetical protein  31.36 
 
 
811 aa  47  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2051  hypothetical protein  31.91 
 
 
583 aa  47  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1887  ankyrin  23.3 
 
 
321 aa  47.4  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.959203 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0393  hypothetical protein  24.75 
 
 
821 aa  47  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  23.5 
 
 
450 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0301  Ankyrin  22.17 
 
 
369 aa  46.2  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00164342  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0418  Ankyrin  24.36 
 
 
352 aa  46.2  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48163  predicted protein  34.31 
 
 
783 aa  46.2  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  27.27 
 
 
581 aa  46.2  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0519  hypothetical protein  25.9 
 
 
278 aa  46.2  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.682563 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05824  Palmitoyltransferase akr1 (EC 2.3.1.-)(Ankyrin repeat-containing protein akr1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B0V6]  27.93 
 
 
737 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3439  ankyrin  24.06 
 
 
337 aa  45.8  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.41623  hitchhiker  0.000120862 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0732  hypothetical protein  32 
 
 
945 aa  46.2  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03543  conserved hypothetical protein  23.73 
 
 
1622 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.088624  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1797  ankyrin repeat-containing protein  23.66 
 
 
483 aa  45.4  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1484  hypothetical protein  29.27 
 
 
790 aa  45.4  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1348  Ankyrin  21.72 
 
 
345 aa  45.1  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0754  Ankyrin  31.17 
 
 
624 aa  44.7  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3488  hypothetical protein  29.6 
 
 
261 aa  44.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.609934  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1999  ankyrin repeat-containing protein  24.49 
 
 
512 aa  44.3  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.224221 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0015  ankyrin  31.58 
 
 
194 aa  44.3  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.189305  hitchhiker  0.00296993 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>