11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_63660 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_63660  hypothetical protein  100 
 
 
411 aa  797    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0174567  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3186  hypothetical protein  54.57 
 
 
414 aa  354  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06671  hypothetical protein  31.75 
 
 
423 aa  206  6e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001115  hypothetical protein  33.41 
 
 
425 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.401895  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4287  hypothetical protein  30.18 
 
 
341 aa  93.2  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.637696  normal  0.308708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1404  hypothetical protein  32.01 
 
 
287 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2879  hypothetical protein  30.15 
 
 
287 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000019953 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5535  hypothetical protein  86.67 
 
 
122 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5452  hypothetical protein  28.57 
 
 
359 aa  51.2  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.0389134 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2372  ankyrin  39.39 
 
 
519 aa  48.1  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0883  Ankyrin  40.45 
 
 
494 aa  46.6  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>