52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_44960 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_44960  hypothetical protein  100 
 
 		 109 aa  221  3e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3825  hypothetical protein  96.33 
 
 		 109 aa  214  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.417534  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1644  protein tyrosine phosphatase-like protein  67.29 
 
 		 107 aa  155  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.294535  normal  0.798793 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1581  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  68.22 
 
 		 108 aa  151  4e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.285184 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0006  hypothetical protein  65.71 
 
 		 107 aa  149  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0720243  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7132  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  64.49 
 
 		 109 aa  148  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1663  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  65.42 
 
 		 108 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.285539  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1183  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  65.42 
 
 		 108 aa  144  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1562  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  65.42 
 
 		 108 aa  143  9e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3428  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  61.9 
 
 		 107 aa  141  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1637  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  64.49 
 
 		 108 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0741559 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4811  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  65.71 
 
 		 107 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.572747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4802  hypothetical protein  58.88 
 
 		 109 aa  138  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1380  hypothetical protein  57.94 
 
 		 107 aa  138  3e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3946  phosphatase  61.9 
 
 		 108 aa  137  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3461  hypothetical protein  50 
 
 		 109 aa  125  3e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3038  hypothetical protein  54.81 
 
 		 112 aa  125  3e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.959689 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2810  hypothetical protein  53.85 
 
 		 112 aa  121  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.984704 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2559  phosphatase  51.96 
 
 		 106 aa  120  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02886  phosphatase  55.88 
 
 		 108 aa  120  9e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3543  hypothetical protein  52.83 
 
 		 108 aa  115  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279946 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2929  hypothetical protein  49.06 
 
 		 107 aa  114  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.57185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3432  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50.94 
 
 		 106 aa  113  6.9999999999999995e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.284191  normal  0.553808 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2603  hypothetical protein  44.76 
 
 		 108 aa  111  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0718  hypothetical protein  42.99 
 
 		 107 aa  103  5e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0770417 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0181  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.79 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0189  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.79 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00160916  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0174  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.79 
 
 		 107 aa  89.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0497104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4974  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  36.54 
 
 		 105 aa  88.2  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000359638 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1082  hypothetical protein  43.88 
 
 		 149 aa  87  8e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2721  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.42 
 
 		 115 aa  85.9  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.203534  normal  0.0645973 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0174  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.75 
 
 		 107 aa  85.5  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0119958  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1113  protein-tyrosine-phosphatase  34.62 
 
 		 107 aa  85.1  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0412586  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3901  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.91 
 
 		 109 aa  84.3  5e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0160871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4364  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  38.32 
 
 		 115 aa  80.9  0.000000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.969843  normal  0.301624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1065  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.46 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3429  protein tyrosine phosphatase  30.77 
 
 		 148 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3317  protein tyrosine phosphatase  29.67 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5441  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  30.61 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000087188  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0097  protein tyrosine phosphatase  30.21 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.858615  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5497  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  30.69 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000011124  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3838  protein tyrosine phosphatase  29.17 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00365174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5410  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.31 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29890  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  34.74 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0626343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5018  protein tyrosine phosphatase  31.31 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000828384  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5001  protein tyrosine phosphatase  31.31 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000640822  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5444  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.7 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000228107  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1076  protein tyrosine phosphatase  26.26 
 
 		 154 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5561  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.31 
 
 		 146 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000566257  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5168  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  31.31 
 
 		 146 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000249866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5510  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase family protein  29.59 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000212559  unclonable  3.15729e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5117  protein tyrosine phosphatase  29.29 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000717991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>