11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_44920 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_44920  hypothetical protein  100 
 
 		 380 aa  783    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00121622  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01938  hypothetical protein  43.54 
 
 		 338 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01936  putative signal peptide protein  41.09 
 
 		 356 aa  266  4e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.193739  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01937  hypothetical protein  45.03 
 
 		 309 aa  266  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.97098  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5269  putative signal peptide protein  36.13 
 
 		 302 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00395  hypothetical protein  27.61 
 
 		 455 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0399379  normal  0.95262 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6902  hypothetical protein  25.56 
 
 		 319 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.554831  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05223  hypothetical protein  26.22 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0638  hypothetical protein  28.09 
 
 		 184 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3170  hypothetical protein  21.67 
 
 		 342 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0289  hypothetical protein  20.99 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>