16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_20720 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_20720  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  301  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1778  hypothetical protein  92.95 
 
 
156 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2855  FlgN family protein  57.69 
 
 
155 aa  165  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.451299  normal  0.245118 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4396  FlgN family protein  43.05 
 
 
155 aa  117  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.435221  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3957  FlgN family protein  43.05 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4256  FlgN  42.31 
 
 
155 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3489  FlgN  42.31 
 
 
155 aa  112  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459728  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1924  hypothetical protein  40.38 
 
 
155 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.254408  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3737  FlgN family protein  39.74 
 
 
155 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.158144  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1458  FlgN family protein  40.38 
 
 
155 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.327454  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2218  putative flagella synthesis protein FlgN  33.09 
 
 
157 aa  65.5  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.632773  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0921  FlgN family protein  34.81 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1212  FlgN family protein  29.75 
 
 
158 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.783285  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0938  hypothetical protein  27.4 
 
 
165 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0968  hypothetical protein  27.4 
 
 
165 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1640  putative flagella synthesis protein FlgN  30.19 
 
 
158 aa  40.8  0.007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0347725  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>