29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_19531 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_19531  integral membrane protein, interacts with FtsH  100 
 
 		 246 aa  473  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.688196 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1514  hypothetical protein  76.83 
 
 		 243 aa  336  1.9999999999999998e-91  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13301  integral membrane protein, interacts with FtsH  72.76 
 
 		 245 aa  325  3e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.796409  normal  0.703525 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14441  integral membrane protein, interacts with FtsH  71.14 
 
 		 245 aa  325  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.467413  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14681  integral membrane protein, interacts with FtsH  70.73 
 
 		 245 aa  318  6e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.243833  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14821  integral membrane protein, interacts with FtsH  70.73 
 
 		 245 aa  318  6e-86  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.90511  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1379  integral membrane protein, interacts with FtsH  70.33 
 
 		 245 aa  317  1e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0885  hypothetical protein  75.61 
 
 		 243 aa  311  7.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0850  integral membrane protein, interacts with FtsH  68.7 
 
 		 245 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17031  integral membrane protein, interacts with FtsH  68.7 
 
 		 245 aa  280  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1820  hypothetical protein  59.02 
 
 		 242 aa  238  5.999999999999999e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.53657  normal  0.302563 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0690  integral membrane protein interacts with FtsH  50.41 
 
 		 242 aa  214  7e-55  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.000220469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0671  hypothetical protein  50.41 
 
 		 242 aa  214  9e-55  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2121  hypothetical protein  50.81 
 
 		 244 aa  211  7.999999999999999e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.899925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2056  hypothetical protein  50 
 
 		 242 aa  199  1.9999999999999998e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.703737 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0296  integral membrane protein, interacts with FtsH  32.18 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1899  integral membrane protein, interacts with FtsH  30.65 
 
 		 237 aa  50.8  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0383513  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0738  protein of unknown function UPF0005  31.94 
 
 		 234 aa  50.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000107382  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1604  hypothetical protein  30.17 
 
 		 229 aa  49.3  0.00005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000120987  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1724  hypothetical protein  29.41 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000390624  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0538  hypothetical protein  29.28 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0424  protein of unknown function UPF0005  26.95 
 
 		 217 aa  46.6  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2972  hypothetical protein  34.34 
 
 		 237 aa  46.6  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416031  normal  0.346292 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0443  hypothetical protein  26.64 
 
 		 256 aa  45.8  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG04050  vacuole protein, putative  25.88 
 
 		 283 aa  45.4  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701829  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4482  protein of unknown function UPF0005  28.18 
 
 		 236 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.295121  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0549  hypothetical protein  30.06 
 
 		 232 aa  43.1  0.004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.235256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4550  hypothetical protein  26.64 
 
 		 236 aa  43.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00145642 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2134  protein of unknown function UPF0005  27.98 
 
 		 235 aa  42.7  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.00000000183428  normal  0.170874 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>