28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0589 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0589  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  308  2e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2917  hypothetical protein  47.37 
 
 
148 aa  133  9e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.043389  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0590  hypothetical protein  49.26 
 
 
161 aa  133  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1785  hypothetical protein  57.5 
 
 
134 aa  127  7.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0132  hypothetical protein  47.45 
 
 
152 aa  122  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436988  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2318  hypothetical protein  46.46 
 
 
152 aa  120  7e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0119  hypothetical protein  48.44 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0765731 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0325  hypothetical protein  41.54 
 
 
159 aa  114  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.571853 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3104  hypothetical protein  35.29 
 
 
70 aa  48.9  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2475  hypothetical protein  35.29 
 
 
70 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250816  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2796  hypothetical protein  33.82 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000387625  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1582  hypothetical protein  33.82 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00572873  hitchhiker  0.000000000892194 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2871  hypothetical protein  33.82 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.061034  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2776  hypothetical protein  33.82 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1392  hypothetical protein  33.82 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  hitchhiker  0.000000000223509 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1457  hypothetical protein  33.82 
 
 
70 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000515055  hitchhiker  0.000343256 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1445  hypothetical protein  33.82 
 
 
70 aa  47  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000274385  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2183  hypothetical protein  33.33 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00725141  hitchhiker  0.00874925 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2612  hypothetical protein  33.85 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.263464  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2690  hypothetical protein  31.88 
 
 
70 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3724  hypothetical protein  34.85 
 
 
67 aa  45.1  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0417243  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1168  hypothetical protein  34.38 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0485265  normal  0.126303 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1821  hypothetical protein  29.21 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0301764  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1105  hypothetical protein  33.33 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1411  hypothetical protein  31.88 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000158578  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2441  hypothetical protein  27.54 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00913666  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2288  hypothetical protein  32.2 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2179  hypothetical protein  36.67 
 
 
68 aa  40  0.01  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000190781  hitchhiker  0.00000346737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>