23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_0132 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_0132  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  301  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436988  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0119  hypothetical protein  92.11 
 
 
152 aa  280  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0765731 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2318  hypothetical protein  80.92 
 
 
152 aa  249  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.817057  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2917  hypothetical protein  57.14 
 
 
148 aa  151  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.043389  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0325  hypothetical protein  46.1 
 
 
159 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.571853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0589  hypothetical protein  47.45 
 
 
151 aa  122  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1785  hypothetical protein  55 
 
 
134 aa  111  3e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0590  hypothetical protein  43.31 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1821  hypothetical protein  52.17 
 
 
121 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0301764  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1458  hypothetical protein  39.68 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.564529  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2690  hypothetical protein  33.33 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3957  hypothetical protein  31.86 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000108412 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2612  hypothetical protein  32.31 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.263464  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2741  hypothetical protein  39.29 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3104  hypothetical protein  36.92 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2796  hypothetical protein  36.92 
 
 
70 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000387625  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2871  hypothetical protein  36.92 
 
 
70 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.061034  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2475  hypothetical protein  36.92 
 
 
70 aa  41.6  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250816  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2776  hypothetical protein  36.92 
 
 
70 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00105057  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1582  hypothetical protein  36.92 
 
 
70 aa  42  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00572873  hitchhiker  0.000000000892194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1445  hypothetical protein  36.92 
 
 
70 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000274385  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1457  hypothetical protein  35.38 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000515055  hitchhiker  0.000343256 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1392  hypothetical protein  35.38 
 
 
70 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000959117  hitchhiker  0.000000000223509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>