41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1157 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1157    100 
 
 		 396 bp  785    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3839  hypothetical protein  85.1 
 
 		 960 bp  317  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.247548  normal  0.0595051 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3743  hypothetical protein  85.1 
 
 		 960 bp  317  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1814  integrase catalytic subunit  85.1 
 
 		 960 bp  317  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0485004  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0053  integrase catalytic subunit  85.06 
 
 		 960 bp  315  4.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142705  normal  0.776199 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3472  hypothetical protein  85.52 
 
 		 513 bp  305  5.000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.119399 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2917  integrase, catalytic region  84.24 
 
 		 966 bp  149  7.0000000000000006e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.437302 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5325  hypothetical protein  86.42 
 
 		 594 bp  147  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.969651  normal  0.742207 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4284    82.61 
 
 		 980 bp  139  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.500601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3767  hypothetical protein  88.78 
 
 		 387 bp  107  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0252  transposase (class I)  81.41 
 
 		 252 bp  101  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1952    89.19 
 
 		 2579 bp  83.8  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0366  integrase, catalytic region  85.42 
 
 		 990 bp  79.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.680873 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2918  integrase, catalytic region  85.42 
 
 		 951 bp  79.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.423404 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2899  integrase, catalytic region  85.42 
 
 		 984 bp  79.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0219368 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0308  integrase, catalytic region  85.42 
 
 		 951 bp  79.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0481  integrase, catalytic region  85.42 
 
 		 951 bp  79.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.791017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0838  integrase, catalytic region  85.42 
 
 		 861 bp  79.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.204021  hitchhiker  0.00436144 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1097  integrase, catalytic region  85.42 
 
 		 951 bp  79.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.495543  normal  0.303219 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1293  integrase, catalytic region  85.42 
 
 		 990 bp  79.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.345302  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1296  integrase, catalytic region  85.42 
 
 		 951 bp  79.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2225  integrase, catalytic region  85.42 
 
 		 951 bp  79.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00213091  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2818  integrase, catalytic region  85.42 
 
 		 951 bp  79.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2839  integrase, catalytic region  85.42 
 
 		 462 bp  79.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.489873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2850  integrase, catalytic region  85.42 
 
 		 990 bp  79.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1717  integrase, catalytic region  85.42 
 
 		 951 bp  79.8  0.0000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0171721  normal  0.307075 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2536    86.75 
 
 		 950 bp  77.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3258  Integrase catalytic region  80 
 
 		 993 bp  69.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2747    80 
 
 		 1062 bp  69.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0487379 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2721  Integrase catalytic region  80 
 
 		 993 bp  69.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.562875  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2676    80 
 
 		 672 bp  69.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.394302  normal  0.345661 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2422  Integrase catalytic region  80 
 
 		 993 bp  69.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2291  Integrase catalytic region  80 
 
 		 1047 bp  69.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.152349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1875  Integrase catalytic region  80 
 
 		 1068 bp  69.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0702445 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1668  Integrase catalytic region  80 
 
 		 993 bp  69.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.412192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0692  Integrase catalytic region  80 
 
 		 993 bp  69.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.229145  normal  0.133209 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0676    80 
 
 		 1031 bp  69.9  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000495528 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5447  Integrase catalytic region  84.27 
 
 		 834 bp  65.9  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.681137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25530  Integrase, catalytic domain-containing protein  83.72 
 
 		 798 bp  60  0.0000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2999    91.3 
 
 		 405 bp  60  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.932196  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1101  putative transposase  94.29 
 
 		 162 bp  54  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.32913 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>