22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0487 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0487  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  100 
 
 
236 aa  481  1e-135  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000293437  normal  0.460106 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1618  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  39.25 
 
 
920 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.308528  normal  0.21645 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17421  hypothetical protein  34.78 
 
 
388 aa  121  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0905  protein of unknown function DUF129  31.88 
 
 
209 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0992  hypothetical protein  30.52 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000209758  normal  0.15397 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2400  hypothetical protein  32.54 
 
 
385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000734126  hitchhiker  0.00220183 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4381  hypothetical protein  33.48 
 
 
391 aa  117  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.29057 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07881  hypothetical protein  32.71 
 
 
388 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.85732  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1632  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  38.17 
 
 
926 aa  108  5e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.740273 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08541  hypothetical protein  31.65 
 
 
388 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5966  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  35.48 
 
 
893 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.111384  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2511  protein of unknown function DUF129  30.62 
 
 
397 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08571  hypothetical protein  31.63 
 
 
388 aa  106  3e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0887  hypothetical protein  31.46 
 
 
215 aa  106  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000149264  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1872  hypothetical protein  29.61 
 
 
386 aa  105  6e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.734  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0801  hypothetical protein  31.16 
 
 
389 aa  103  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19000  hypothetical protein  31.84 
 
 
509 aa  101  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.404915  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09681  hypothetical protein  30.58 
 
 
384 aa  99  6e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.200555  hitchhiker  0.00527786 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10450  asparagine synthase, glutamine-hydrolyzing  31.02 
 
 
938 aa  95.1  9e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00957139  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0781  hypothetical protein  30.1 
 
 
381 aa  92.4  5e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.354225  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08331  hypothetical protein  28.77 
 
 
325 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.267137 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0201  hypothetical protein  30.14 
 
 
382 aa  88.6  7e-17  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.142897  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>