16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4580 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4580  hypothetical protein  100 
 
 
429 aa  826    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4584  glycosyl transferase family protein  48.64 
 
 
546 aa  335  7e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0618  glycosyl transferase family 2  45.56 
 
 
670 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.958983  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1641  hypothetical protein  42.49 
 
 
640 aa  226  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0634  hypothetical protein  41.04 
 
 
513 aa  212  7.999999999999999e-54  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.135526 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1644  hypothetical protein  44.09 
 
 
373 aa  183  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.946306 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0881  family 2 glycosyl transferase  43.87 
 
 
369 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0159  family 2 glycosyl transferase  34.78 
 
 
694 aa  102  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27770  hypothetical protein  38.43 
 
 
641 aa  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0373  hypothetical protein  35.89 
 
 
685 aa  100  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26800  glycosyl transferase  31.45 
 
 
617 aa  93.2  8e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.955203 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26830  hypothetical protein  30.74 
 
 
629 aa  87.4  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0624  glycosyltransferase  28 
 
 
249 aa  73.2  0.000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1635  hypothetical protein  34.87 
 
 
650 aa  70.1  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.168505  normal  0.43752 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1469  glycosyl transferase family 2  26.46 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0876  hypothetical protein  30.18 
 
 
671 aa  48.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.912844  normal  0.438141 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>