20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3731 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3731  hypothetical protein  100 
 
 
456 aa  885    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4077  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.4 
 
 
3602 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1324  hypothetical protein  36.97 
 
 
279 aa  64.7  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.431551  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0670  hypothetical protein  30.6 
 
 
172 aa  61.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0520  hypothetical protein  30.66 
 
 
172 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0569  putative lipoprotein  31.86 
 
 
173 aa  60.1  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000903334  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4012  hypothetical protein  32.46 
 
 
274 aa  59.7  0.00000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0513  hypothetical protein  31.86 
 
 
173 aa  60.1  0.00000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000669276  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0511  hypothetical protein  31.86 
 
 
173 aa  60.1  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0779722  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0602  putative lipoprotein  31.86 
 
 
172 aa  59.7  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0729  putative lipoprotein  31.86 
 
 
172 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0658  putative lipoprotein  31.86 
 
 
172 aa  59.7  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.9941600000000005e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0640  putative lipoprotein  29.2 
 
 
172 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4698  putative lipoprotein  29.2 
 
 
172 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000879271 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0516  hypothetical protein  30.97 
 
 
172 aa  57.8  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13938  hypothetical protein  31.58 
 
 
846 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250303  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1118  hypothetical protein  27.16 
 
 
421 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.497479  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1397  hypothetical protein  32.5 
 
 
289 aa  48.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.157715  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0115  hypothetical protein  27.27 
 
 
277 aa  46.2  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0529  hypothetical protein  25.23 
 
 
372 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>