16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3701 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3701  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  328  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.134012  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3604  protein of unknown function DUF402  44.71 
 
 
173 aa  115  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0611051  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1646  hypothetical protein  39.88 
 
 
186 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.8191  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1639  hypothetical protein  37.58 
 
 
194 aa  100  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000840175 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1004  hypothetical protein  41.01 
 
 
198 aa  100  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2379  hypothetical protein  39.55 
 
 
166 aa  89  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17636  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0281  hypothetical protein  38.51 
 
 
168 aa  87.4  9e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0437865 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0324  hypothetical protein  37.89 
 
 
168 aa  85.1  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2386  hypothetical protein  29.61 
 
 
188 aa  52.4  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125037  hitchhiker  0.00068546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0474  hypothetical protein  25.9 
 
 
177 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00172302  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1921  hypothetical protein  24.36 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1955  hypothetical protein  24.36 
 
 
180 aa  45.1  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1350  hypothetical protein  28.21 
 
 
178 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1405  hypothetical protein  23.08 
 
 
180 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1055  hypothetical protein  25 
 
 
176 aa  41.2  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.195641  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0673  hypothetical protein  27.27 
 
 
189 aa  41.2  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.413184  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>