178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1522 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1522  hypothetical protein  100 
 
 		 378 aa  758    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.975012  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4395  hypothetical protein  62.24 
 
 		 337 aa  408  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0614  hypothetical protein  60.77 
 
 		 344 aa  389  1e-107  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00333574 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5061  hypothetical protein  60.12 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5149  hypothetical protein  60.12 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5440  hypothetical protein  59.82 
 
 		 334 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.763333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0226  hypothetical protein  57.43 
 
 		 356 aa  380  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.171941  normal  0.010649 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0198  hypothetical protein  58.57 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3374  PHP domain protein  60.24 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0395  hypothetical protein  61.01 
 
 		 339 aa  373  1e-102  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5687  hypothetical protein  58.58 
 
 		 335 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0196791 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1121  hypothetical protein  58.63 
 
 		 334 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13892  hypothetical protein  59.82 
 
 		 335 aa  371  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1064  hypothetical protein  59.76 
 
 		 339 aa  370  1e-101  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.740781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06190  hypothetical protein  56.93 
 
 		 360 aa  358  7e-98  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0448  PHP domain protein  57.39 
 
 		 357 aa  350  2e-95  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4865  hypothetical protein  57.1 
 
 		 332 aa  336  3.9999999999999995e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.113999  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1901  PHP domain protein  59.45 
 
 		 347 aa  333  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4036  hypothetical protein  56.07 
 
 		 381 aa  331  2e-89  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1105  DNA-dependent DNA polymerase family X protein  41.74 
 
 		 557 aa  189  8e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0282445  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0486  PHP-like protein  42.58 
 
 		 574 aa  187  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0081  family X DNA polymerase IV  40.5 
 
 		 563 aa  182  9.000000000000001e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.439053  normal  0.0727641 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1748  PHP-like  41.09 
 
 		 650 aa  176  7e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00399585  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0265  PHP domain protein  39.84 
 
 		 578 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2044  PHP domain protein  38.68 
 
 		 557 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2633  hypothetical protein  38.68 
 
 		 572 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000221598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0250  PHP domain protein  40.85 
 
 		 578 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055482 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0823  hypothetical protein  38.43 
 
 		 574 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0486  phosphotransferase domain-containing protein  38.28 
 
 		 570 aa  173  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2389  DNA polymerase X family protein  39.09 
 
 		 584 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0007  phosphotransferase domain-containing protein  40 
 
 		 580 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0296814  unclonable  0.000000000565114 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1075  PHP domain protein  37.86 
 
 		 584 aa  171  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0958  PHP domain protein  39.83 
 
 		 574 aa  170  3e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0038338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0599  DNA-binding/PHP domain-containing protein  35.71 
 
 		 578 aa  169  5e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000111495  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1586  DNA Polymerase X family  35.71 
 
 		 594 aa  169  6e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0273065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4297  hypothetical protein  36.63 
 
 		 572 aa  169  9e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.558706  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4679  hypothetical protein  36.63 
 
 		 572 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0956211  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4448  hypothetical protein  36.63 
 
 		 572 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4286  hypothetical protein  36.63 
 
 		 572 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000879454  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4795  hypothetical protein  36.63 
 
 		 572 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.114766  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4666  hypothetical protein  36.63 
 
 		 573 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000070928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4013  phosphotransferase domain-containing protein  39.67 
 
 		 578 aa  168  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0112  PHP domain protein  42.32 
 
 		 562 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4663  hypothetical protein  36.63 
 
 		 573 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00758489  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3241  hypothetical protein  36.63 
 
 		 572 aa  167  2e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287288  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4679  hypothetical protein  36.63 
 
 		 573 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000348289  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6300  DNA-directed DNA polymerase  40.89 
 
 		 560 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984431  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2830  PHP domain protein  39.92 
 
 		 577 aa  167  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1963  phosphotransferase domain-containing protein  39.76 
 
 		 614 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.4254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4381  hypothetical protein  35.8 
 
 		 572 aa  166  8e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.150026  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1315  phosphotransferase domain-containing protein  36.67 
 
 		 588 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0076  phosphotransferase domain-containing protein  39.09 
 
 		 580 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0741749  normal  0.105314 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2341  PHP domain-containing protein  39.3 
 
 		 536 aa  165  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05670  DNA polymerase X family protein  35.96 
 
 		 573 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0575  hypothetical protein  35.8 
 
 		 573 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000426901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1664  phosphotransferase domain-containing protein  40 
 
 		 577 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1131  PHP domain protein  38.08 
 
 		 532 aa  162  9e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.481638 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5653  PHP domain protein  41.2 
 
 		 572 aa  162  1e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0726  hypothetical protein  34.71 
 
 		 569 aa  161  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0230  PHP-like protein  40.66 
 
 		 569 aa  160  4e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.4179  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2126  DNA-directed DNA polymerase  39.48 
 
 		 562 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.403637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1723  PHP domain protein  40 
 
 		 560 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00699818  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1446  DNA polymerase X  39.83 
 
 		 574 aa  158  1e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0654387  normal  0.735552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0901  PHP-like  38.82 
 
 		 598 aa  158  1e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1634  phosphotransferase domain-containing protein  36.91 
 
 		 569 aa  158  2e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1323  PHP domain protein  38.2 
 
 		 582 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3075  PHP domain protein  39.06 
 
 		 558 aa  156  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216052 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3104  DNA polymerase X family protein  39.24 
 
 		 576 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.533704  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2703  PHP domain protein  39.24 
 
 		 576 aa  156  6e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00677466  hitchhiker  0.00000000129938 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4543  PHP domain protein  38.17 
 
 		 582 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00710379 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1600  PHP domain protein  33.98 
 
 		 580 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4410  PHP domain protein  38.17 
 
 		 582 aa  155  1e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.969464 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1213  hypothetical protein  38.63 
 
 		 574 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.224332  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1642  bifunctional DNA polymerase X family protein/ histidinol phosphatase  35.8 
 
 		 584 aa  154  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1597  hypothetical protein  37.13 
 
 		 566 aa  154  2e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0710  DNA polymerase X family protein  38.58 
 
 		 642 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.963352  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1202  hypothetical protein  35.59 
 
 		 570 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1224  hypothetical protein  35.59 
 
 		 570 aa  154  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0650  phosphotransferase domain-containing protein  34.51 
 
 		 570 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.694552  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2005  DNA polymerase X family/PHP domain-containing protein  38.58 
 
 		 650 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0829  PHP-like  39.83 
 
 		 580 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1814  PHP domain protein  34.76 
 
 		 571 aa  151  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.873874  normal  0.593252 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1609  PHP-like protein  40.16 
 
 		 572 aa  150  3e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.379827 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0618  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  41.52 
 
 		 740 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.138492  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1792  DNA-directed DNA polymerase  38.02 
 
 		 576 aa  149  9e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.197029  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2447  PHP domain protein  40.33 
 
 		 580 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.335837  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1766  phosphotransferase domain-containing protein  41.45 
 
 		 576 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5838  PHP domain protein  39.15 
 
 		 592 aa  147  4.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1948  PHP domain protein  35.83 
 
 		 576 aa  147  4.0000000000000006e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.453444  normal  0.722452 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2634  DNA-directed DNA polymerase  35.42 
 
 		 583 aa  146  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4412  PHP domain protein  37.04 
 
 		 579 aa  146  6e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6605  DNA-directed DNA polymerase  37.34 
 
 		 586 aa  144  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.403533  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1440  PHP domain protein  34.46 
 
 		 576 aa  143  4e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0200406  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1134  DNA-directed DNA polymerase  34.71 
 
 		 586 aa  142  9e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.402489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1288  PHP domain protein  38.63 
 
 		 592 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0703959  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1389  PHP domain protein  38.2 
 
 		 592 aa  136  5e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.460658  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2560  phosphoesterase, PHP-like  38.2 
 
 		 592 aa  136  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.708367  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1730  DNA-directed DNA polymerase  34.91 
 
 		 570 aa  134  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0586087  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1786  phosphotransferase domain-containing protein  34.58 
 
 		 543 aa  134  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1302  phosphotransferase domain-containing protein  37.66 
 
 		 589 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>