23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0399 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_0399  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  152  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2629  hypothetical protein  87.67 
 
 
74 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0527  hypothetical protein  83.56 
 
 
73 aa  133  9.999999999999999e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1398  hypothetical protein  82.19 
 
 
73 aa  127  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02183  hypothetical protein  89.09 
 
 
55 aa  105  2e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.85763  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1114  hypothetical protein  63.01 
 
 
77 aa  103  8e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.604065 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3573  hypothetical protein  46.15 
 
 
78 aa  73.6  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4620  hypothetical protein  36.23 
 
 
74 aa  62.8  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0281  hypothetical protein  42.62 
 
 
75 aa  58.2  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804156  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0200  hypothetical protein  46.43 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.717937 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0897  hypothetical protein  45.76 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138918  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0841  hypothetical protein  49.15 
 
 
75 aa  55.1  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.159049  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1576  hypothetical protein  40.98 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28580  hypothetical protein  36.51 
 
 
73 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000012417 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4260  hypothetical protein  34.29 
 
 
107 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.336712  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2494  hypothetical protein  33.33 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.908795  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1026  hypothetical protein  34.62 
 
 
78 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1148  hypothetical protein  33.87 
 
 
78 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0669  hypothetical protein  33.87 
 
 
99 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1124  hypothetical protein  33.87 
 
 
81 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00431481  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1030  hypothetical protein  34.62 
 
 
78 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.514521  normal  0.822013 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2486  hypothetical protein  32.84 
 
 
76 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00701506  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0222  hypothetical protein  27.27 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>