16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2395 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2395  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  610  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.511829  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3646  hypothetical protein  30.33 
 
 
414 aa  73.6  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0628456 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1054  hypothetical protein  36.27 
 
 
443 aa  73.2  0.000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1194  hypothetical protein  33.67 
 
 
450 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.255912  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3322  hypothetical protein  37.5 
 
 
240 aa  54.7  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.031889  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3705  hypothetical protein  33.33 
 
 
417 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5510  hypothetical protein  33.33 
 
 
417 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2334  hypothetical protein  30.61 
 
 
141 aa  53.1  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2722  hypothetical protein  26.45 
 
 
301 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000050933  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3014  hypothetical protein  29 
 
 
135 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3265  hypothetical protein  28.95 
 
 
135 aa  51.6  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.210422 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1912  hypothetical protein  31.18 
 
 
149 aa  50.1  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247527  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2793  hypothetical protein  26.67 
 
 
448 aa  49.7  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3447  hypothetical protein  28.43 
 
 
134 aa  49.7  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1661  hypothetical protein  25.23 
 
 
132 aa  47.8  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606542 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4235  hypothetical protein  32.65 
 
 
209 aa  47  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00996764  normal  0.427683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>