52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1877 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1877  hypothetical protein  100 
 
 
587 aa  1205    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.220347  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1969  hypothetical protein  65.21 
 
 
581 aa  726    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1851  TPR repeat-containing protein  48.84 
 
 
571 aa  478  1e-134  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2694  TPR repeat-containing protein  44.52 
 
 
580 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.407623  normal  0.0520639 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2335  Tetratricopeptide domain protein  46.71 
 
 
563 aa  468  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0014328 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0555  tetratricopeptide region  43.02 
 
 
560 aa  460  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.45789  normal  0.384774 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3429  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  46.08 
 
 
572 aa  457  1e-127  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2675  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  45.88 
 
 
572 aa  452  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20870  Tetratricopeptide repeat (TPR) protein  48.16 
 
 
539 aa  442  9.999999999999999e-123  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1371  TPR repeat-containing protein  46.69 
 
 
601 aa  432  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432859  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4467  Tetratricopeptide repeat protein  45.4 
 
 
568 aa  426  1e-118  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.412623  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1581  Tetratricopeptide domain protein  41.75 
 
 
578 aa  419  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00337533  normal  0.487012 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2869  hypothetical protein  43.85 
 
 
568 aa  417  9.999999999999999e-116  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.451672  normal  0.628109 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2264  hypothetical protein  39.65 
 
 
621 aa  403  1e-111  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.750308  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2307  TPR repeat-containing protein  44.02 
 
 
598 aa  383  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.062343 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0768  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 
552 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.400083 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2863  TPR repeat-containing protein  41.42 
 
 
525 aa  351  2e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0105182  normal  0.334378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1486  TPR repeat-containing protein  38.61 
 
 
623 aa  325  1e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4301  TPR repeat-containing protein  39.22 
 
 
625 aa  319  1e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3291  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.01 
 
 
625 aa  310  5e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3942  TPR repeat-containing protein  35.92 
 
 
563 aa  305  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.171262  normal  0.567153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1004  TPR repeat-containing protein  36.57 
 
 
625 aa  301  2e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1317  TPR repeat-containing protein  39.03 
 
 
533 aa  288  2e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.573669  normal  0.99771 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02878  conserved hypothetical protein  35.7 
 
 
594 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.291051 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2608  TPR domain-containing protein  35.62 
 
 
601 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1465  TPR repeat-containing protein  36.22 
 
 
574 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.388393  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1379  TPR repeat-containing protein  36.8 
 
 
559 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2769  tetratricopeptide TPR_2  35.91 
 
 
563 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.156917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2813  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 
563 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.48594  normal  0.196641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2796  TPR repeat-containing protein  35.91 
 
 
563 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.489638  normal  0.742166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3057  TPR repeat-containing protein  36.41 
 
 
559 aa  276  8e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.297776 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1113  TPR repeat-containing protein  36.25 
 
 
537 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0490058  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0462  TPR domain-containing protein  36.25 
 
 
537 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0186  TPR domain-containing protein  36.25 
 
 
537 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.240778  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1219  TPR domain-containing protein  36.25 
 
 
537 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.121944  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0989  hypothetical protein  34.25 
 
 
577 aa  271  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.659659  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03987  TPR domain protein (AFU_orthologue; AFUA_3G00240)  34.55 
 
 
580 aa  271  2e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3331  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 
565 aa  265  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.643296  normal  0.0437808 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0381  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.89 
 
 
559 aa  262  1e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.850569  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4326  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.55 
 
 
584 aa  259  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03470  conserved expressed protein  32.96 
 
 
576 aa  257  5e-67  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0846142  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02657  conserved hypothetical protein  31.24 
 
 
600 aa  237  5.0000000000000005e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.0000025246  normal  0.0917143 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_38668  predicted protein  33.42 
 
 
626 aa  173  9e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0793283  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3655  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 
506 aa  126  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2242  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 
541 aa  118  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.433133  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1942  tetratricopeptide TPR_4  25.93 
 
 
530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3941  alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen  27.58 
 
 
871 aa  107  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.817968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5657  tetratricopeptide TPR_4  24.18 
 
 
530 aa  99.8  1e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1061  tetratricopeptide domain-containing protein  27.92 
 
 
556 aa  90.9  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2073  TPR repeat-containing protein  27.09 
 
 
532 aa  67.4  0.0000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.378967 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2168  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.59 
 
 
537 aa  49.7  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0808  TPR repeat-containing protein  23.58 
 
 
486 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224492  normal  0.93988 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>