17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1362 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1362  hypothetical protein  100 
 
 
113 aa  227  5e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1152  hypothetical protein  65.52 
 
 
89 aa  120  7e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.314563 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0877  putative transcriptional regulator  41.82 
 
 
110 aa  84.3  6e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.199532 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0876  hypothetical protein  35.71 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.195647 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  38.81 
 
 
131 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1306  hypothetical protein  30.43 
 
 
116 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000189351 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5175  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  46.6  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.937206  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1053  hypothetical protein  28.92 
 
 
119 aa  45.1  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.256423  normal  0.612882 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3712  hypothetical protein  28.4 
 
 
131 aa  44.3  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.598339  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1390  hypothetical protein  27.55 
 
 
118 aa  43.9  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4287  putative transcriptional regulator, AsnC family  28.57 
 
 
132 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.132275  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1445  transcriptional regulator, ArsR family  27.14 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.481445  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2339  hypothetical protein  25.71 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3365  hypothetical protein  27.78 
 
 
115 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.753512  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3007  hypothetical protein  29.73 
 
 
110 aa  42  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0952791  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1221  hypothetical protein  25.58 
 
 
117 aa  41.2  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0559  transcription regulator  28.57 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.4185 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>